ECOLE-CHERCHEURS

GENOMIQUE ET DIVERSITE DES CARACTERES A DETERMINISME COMPLEXE

Programme provisoire

 

Dimanche 15 mai

 
20:30-21:30
Conférence introductive
Variation quantitative, héritabilité, interactions entre gènes, effets du milieu, pénétrance, etc.
Christine Dillmann (Univ. Paris Sud, Gif-sur-Yvette).

 

Lundi 16 mai

 

08:30-09:30
09:30-10:00
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10:30-11:00

 

11:00-11:50
11:50-12:30

12:30-14:00

 
14:00-16:30
 

16 :30-17:00

17:00-18:00
18:00-18:40
18:40-19:20

Session 1 - Les concepts de base

Les approches de modélisation de la variation quantitative. Stéphane Robin (INRA, Paris)
La notion de phénotype. Jean-Michel Elsen (INRA, Toulouse)
Fitness, paysage adaptatif, traits d’histoire de vie. Ophélie Ronce (CNRS, Montpellier)

Pause

Session 2 - Etude du déterminisme des caractères complexe : outils et méthodes

Déséquilibre de liaison, détection de gènes à effets quantitatifs et populations structurées. Alain Charcosset (INRA, Gif-sur-Yvette)
Détection de gènes impliqués dans les maladies multifactorielles. Catherine Bourgain (INSERM, Villejuif)

Déjeuner

Ateliers
Détection de QTL, génétique d’association, structure des populations, fouilles de données génomiques, bioinformatique, plans d’expérience.

Pause

Nouvelles technologies de séquençage (NGS). Philippe Glaser (CNS, Evry)
Contrôle de la fréquence de recombinaison le long du génome. Bernard de Massy (CNRS, Montpellier)
Interactions génotype-milieu. Fabrice Roux (CNRS, Lille)

 

Mardi 17 mai

 

08:30-09:10

09:10-09:30

09:30-10:10
 

10:10-10:40

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11:00-11:20

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14:00-16:30
 

16:30-17:00

17:00-17:40
17:40-18:10
18:10-18:30

Session 3 - Caractérisation des gènes impliqués dans la variation des caractères complexes

Caractérisation des gènes impliqués dans la variation des caractères complexes : les leçons d’Arabidopsis. Olivier Loudet (INRA, Versailles)
QTL de tolérance au zinc chez Arabidopsis halleri. Hélène Frérot (Univ. Lille 1)
Caractérisation des gènes impliqués dans la variation des caractères complexes : exemples chez les animaux. Bertrand Bed'hom (INRA, Jouy-en-Josas)

Pause

Intérêt des approches de génétique d'association chez le piment. Véronique Lefebvre (INRA, Avignon)
Les populations MAGIC de blé tendre : estimation du déséquilibre de liaison. Stéphanie Thépot (INRA, Gif-sur-Yvette)
Génomique comparative des espèces domestiquées : le projet ARCAD. Jacques David (SupAgro, Montpellier)

Contrôle génétique du ralentissement des épidémies d'anthracnose chez le pois. Carole Giorgetti (INRA, Le Rheu)

Déjeuner

Ateliers
Détection de QTL, génétique d’association, structure des populations, fouilles de données génomiques, bioinformatique, plans d’expérience.

Pause

Les QTL d’expression (eQTL). Gaël Yvert (ENS Lyon).
Caractérisation de gènes liés à la fitness dans les populations naturelles. Pierrick Labbé (Univ. Montpellier 2)
Tolérance au trypanosome dans une population bovine d'Afrique de l'Ouest. Sophie Thévenon (CIRAD, Montpellier)

Posters

 

Mercredi 18 mai

 

08:30-09:10
09:10-09:50

09:50-10:20

 

10:20-11:00
11:00-11:20

11:20-11:40


11:40-12:30
 

12:30

Session 4 - La variabilité « non standard »

La variabilité épigénétique. Vincent Colot (CNRS-ENS Paris)
Les éléments transposables. Clémentine Vitte (CNRS, Gif-sur-Yvette)

Pause

Session 5 - Génomique écologique

Paysages adaptatifs et modèles de mutation. Thomas Lenormand (CNRS, Montpellier)
Pléiotropie et hétérogénéité génomique de la mutation : conséquences évolutives. Luis-Miguel Chevin (Imperial College, Londres)
Adaptation à des régimes alimentaires : éleveurs-nomades et agriculteurs en Asie centrale. Evelyne Heyer (MNHN, Paris)

Table ronde
Les enjeux de la médecine prédictive. Exposé liminaire de Jean-Louis Mandel (Collège de France, Paris). Débat animé par Jean-Louis Mandel et Françoise Clerget (INSERM, Villejuif)

Déjeuner, poster, temps libre.

 

Jeudi 19 mai

 

08:30-09:10
 
09:10-09:50
09:50-10:10

10:10-10:40

10:40-11:20
11:20-12:00
12:00-12:20
 

12:30-14:00

 
14:00-16:30
 

16:30-17:00

 

17:00-17:40
17:40-18:20
18:20-18:40

18:40-19:00
 

 

19:00-19:40

Session 5 - Génomique écologique (suite)

Apports de la génomique écologique à la définition du risque épidémiologique de la maladie de Chagas. Myriam Harry (LEGS, Univ. Paris Sud)
Traces de sélection dans les populations humaines. Guillaume Laval (Institut Pasteur, Paris)
Evolution de la variance génétique et adaptation à un nouvel habitat. Florence Débarre (CNRS, Montpellier)

Pause

Les hot-spots de sélection positive chez les primates. Hughes Roest-Croellius (ENS Paris)
Domestication des animaux : l’exemple de la chèvre. François Pompanon (Univ. Joseph Fourier, Grenoble)
Une méthode de détection des traces de sélection chez les animaux domestiques, prenant en compte l'histoire des races. Magali San Cristobal (INRA, Toulouse)

Déjeuner

Ateliers
Détection de QTL, génétique d’association, structure des populations, fouilles de données génomiques, bioinformatique, plans d’expérience.

Pause

Session 6 - Modélisation multi-échelle

Le phénotypage. Alexandra Jullien (INRA, Grignon)
Inférences de réseaux biologiques. Christophe Giraud (Ecole Polytechnique, Palaiseau)
Evolution de la diversité génétique dans un réseau de régulation degèes soumis à la sélection. Jean-Tristan Brandenburg (ESE, Univ. Paris Sud)
Dissection de la spécificité génétique des interactions vecteur-pathogène : le moustique et la dengue. Louis Lambrechts (Institut Pasteur, Paris)

Session 4 (fin) - La variabilité « non standard »

Les notions de core et de pan génomes. Erick Denamur (INSERM-Univ. Paris VII)

 

Vendredi 20 mai

 

08:30-09:10
09:10-09:50

09:50-10:20

10:20-11:00
11:00-11:40

11:40-12:30

Session 7 - Implications et applications de la génomique des caractères complexes

Hétérosis. Dominique de Vienne (Univ. Paris Sud, Gif-sur-Yvette)
Sélection génomique. Didier Boichard (INRA, Jouy)

Pause

Pharmacogénomique. Audrey Sabbagh (Univ. Paris Descartes, Paris).
Diversité génomique et gestion des ressources génétiques. Jean-Christophe Glaszmann (CIRAD, Montpellier)

Discussion-bilan de l'Ecole-chercheurs

 

Les inscriptions sont closes.

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Contact : Alice Vettoretti - alice.vettoretti@moulon.inra.fr - tél. 06 89 94 12 58 ou 09 52 75 55 16