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Publications in refereed journals

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  • Ainouche, A., Bétermier, M., Chandler, M., Cordaux, R., Cristofari, G., Deragon, J.-M., Lesage, P., Panaud, O., Quesneville, H., Vaury, C., Vieira, C. , Vitte, C. (2012) International Congress on Transposable Elements (ICTE) 2012 in Saint Malo and the sea of TE stories. Mob DNA, 3 17.
  • Allard, V., Veisz, O., Kõszegi, B., Rousset, M., Le Gouis, J. , Martre, P. (2012) The quantitative response of wheat vernalization to environmental variables indicates that vernalization is not a response to cold temperature. J Exp Bot, 63 847–857.
  • Amiour, N., Imbaud, S., Clément, G., Agier, N., Zivy, M., Valot, B., Balliau, T., Armengaud, P., Quilleré, I., Cañas, R., Tercet-Laforgue, T., Hirel, B. (2012) The use of metabolomics integrated with transcriptomic and proteomic studies for identifying key steps involved in the control of nitrogen metabolism in crops such as maize. J. Exp. Bot., 63 5017–5033.
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  • Rincent, R., Laloë, D., Nicolas, S., Altmann, T., Brunel, D., Revilla, P., Rodríguez, V. M., Moreno-Gonzalez, J., Melchinger, A., Bauer, E., Schoen, C.-C., Meyer, N., Giauffret, C., Bauland, C., Jamin, P., Laborde, J., Monod, H., Flament, P., Charcosset, A. , Moreau, L. (2012) Maximizing the reliability of genomic selection by optimizing the calibration set of reference individuals: Comparison of methods in two diverse groups of maize inbreds (Zea mays L.). Genetics, 192 715–728.
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PhD theses defended in the laboratory


Fustier, M.-A. (2016) Adaptation locale des téosintes Zea mays ssp. parviglumis et ssp. mexicana le long de gradients altitudinaux. PhD Thesis. ED Science du Végétal : du gène à l’écosystème, Université Paris-Sud.

Giraud, H. (2016) Genetic analysis of hybrid value for silage maize in multiparental designs: QTL detection and genomic selection. PhD Thesis. ED ABIES, Université Paris-Sud.


Henry, A. (2015) Modélisation cinétique du métabolisme : construction du modèle, analyse et applications biotechnologiques. PhD thesis. ED Frontières du Vivant, Université Paris-Diderot.

Urien, C. (2015) Diversité des espèces de levures dans des levains naturels français produits à partir de farine issue de l'agriculture biologique : une étude pilote pour analyser les pratiques boulangères et les patterns des communautés microbienne. PhD thesis. ED Structure et Dynamique des Systèmes Vivants, Université Paris-Sud.


da Silva, T. (2014) Exploration du phénomène d’hétérosis chez les deux espèces de levure d’œnologie, Saccharomyces cerevisiae et Saccharomyces uvarum. PhD Thesis. ED Gènes, Génomes, Cellules, Université Paris-Sud.

Martinez-Palacios, P. (2014) Réponse des agents non codants du génome – éléments transposables et petits ARN – à un événement d'allopolyploïdie : le génome du colza (Brassica napus) comme modèle d'étude. PhD thesis. ED  Sciences du Végétal, Université Paris Sud.

Rincent R. (2014) Optimization of association genetics and genomic selection strategies for populations of different diversity levels. Application in maize (Zea mays L.). PhD thesis. ED ABIES, AgroParisTech.

Roy, S. B. (2014) Models of meiotic crossover formation, heterogeneity and inter-pathway cross-talks. PhD thesis. ED Gènes, Génomes, Cellules, Université Paris Sud.

Thépot, S. (2014) Utilisation d'une population multi-parentale et hautement recombinante de blé tendre pour l'étude de l'architecture génétique de la précocité de floraison. PhD thesis. ED Sciences du Végétal, Université Paris Sud.


Bardol, N. (2013) Interest of dense genotyping for selection in multi-parental designs. Comparison of two marker-assisted selection approaches: Genomewide selection and QTL-LDLA based selection. Application in maize (Zea mays L.). PhD thesis. ED ABIES, Université Paris Sud.
Gonçalves, B. (2013) Origine génétique et moléculaire, et rôle adaptatif d'un dimorphisme floral chez Nigella damascena L. PhD thesis. ED SdV, Université Paris Sud.
Khan, Abdul (2013) Short term response of European wheat to contrasted agro-climatic conditions: a genetic analysis and first step towards development of epigenetic markers in earliness gene. PhD thesis. ED SdV, Université Paris Sud.
Khobragade, A. (2013) Combining linkage analysis and association genetics to finely map loci involved in maize grain production and maturation -- Cartographie fine de locus impliqués dans la production et la maturation du grain chez le maïs par une approche conjointe de linkage et de génétique d’association. PhD thesis. ED SdV, Université Paris Sud.


Larièpe, A. (2012) Bases génétiques de la vigueur hybride (hétérosis) chez le maïs (Zea mays L.) : Cartographie de QTL dans un dispositif multiparental et cartographie fine par génétique d’association. PhD thesis. ED SdV, Université Paris Sud.


Durand, E. (2011) Étude des bases (épi)génétiques de l'adaptation dans une expérience de sélection divergente pour la précocité de floraison chez le maïs. PhD thesis. ED sdv Université Paris Sud XI - Orsay.
Sarilar, V. (2011) Dynamique d'activation des éléments transposables au cours de la formation d'un génome allopolyploïde. Modèle d'étude : le colza (Brassica napus). PhD thesis. ED ABIES, AgroParisTech.
Thomas, M. (2011) Gestion dynamique à la ferme de l'agrobiodiversité : relation entre la structure des populations de blé tendre et les pratiques humaines. PhD thesis. ED Frontières du Vivant, Université Paris Diderot. pp273
Truntzler, M. (2011) Identification of loci involved in the variation of quality of silage corn: QTL meta-analysis and association mapping. PhD thesis. ED ABIES, AgroParisTech.
Virlouvet, L. (2011) Identification et caractérisation de gènes impliqués dans la variation de caractères quantitatifs affectés par la sécheresse chez le maïs. PhD thesis. ED SdV, Université Paris Sud XI - Orsay. pp 293



Corbi, J. (2010) Sélection et coévolution de gènes paralogues impliqués dans la  synthèse d'amidon au cours de la radiation des angiospermes et chez le maïs, depuis sa domestication. PhD thesis. ED SdV, Université Paris Sud XI - Orsay.
Rousselle, Y. (2010) Rôle de la migration dans le gestion dynamique des ressources génétiques végétales. PhD thesis ED SdV Université Paris Sud XI - Orsay
Sabarly, V. (2010) Structuration de la diversité métabolique chez Escherichia coli : intégration du réseau métabolique, du protéome, des paramètres enzimatiques et des phénotypes de croissance. PhD thesis. ED GGC, Université Paris Sud XI - Orsay.


Spor, A. (2009) Adaptative strategies to contrasted environments in  Saccharaomyces cerevisiae populations. PhD thesis. ED GGC, Université Paris Sud XI - Orsay.
Jabbour, F. (2009)  Homoplasie de la symétrie bilatérale chez les eudicots. Quels rôles de l’architecture florale et du développement ? Quelles bases génétiques ? PhD thesis ED SdV Université Paris Sud XI - Orsay. AgroParisTech.


Rhoné, B. (2008) Etude des mécanismes génétiques impliqués dans l’adaptation climatique de populations expérimentales de Blé tendre. PhD thesis. Institut des Sciences et Industries du Vivant et de l’Environnement - AgroParisTech.


Edelist, C. (2007) Patron de polymorphisme et signature moeculaire de l'adaptation au milieu salin de Helianthus paradoxus. PhD thesis. Université Paris Sud XI - Orsay.


Blanc, G. (2006) Sélection assistée par marqueurs (SAM) dans un dispositif multiparental connecté. Application au maïs et approche par simulations. PhD thesis. INA-PG.
Camus, L. (2006) Evolution génomique du maïs lors de son adaptation aux conditions européennes. PhD thesis. ED Biologie Intégrative.  
Coque, M. (2006) Base génétiques et physiologiques de la remobilisation et de l’absorption post-floraison de l’azote chez le maïs. PhD thesis. INA-PG, école doctorale Abies.
Veyrieras, J.-B. (2006) Etude du déterminisme génétique de caractères quantitatifs chez les végétaux – Méta-analyse et études d’association. PhD thesis. Thèse école doctorale Abies.



Albertin, W. (2005) Régulation de l’expression des gènes dupliqués chez les polyploïdes: Approche protéomique appliquée à l’analyse de Brassicacées autoployploïdes et allopolyploïdes. PhD thesis. Thèse de doctorat en sciences de l’Univ Paris-Sud XI.
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