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Thème de Recherches

Thèmes d'ACEP

1. Génotypage et analyse de polymorphisme de séquence de l'ADN

- Marqueurs microsatellites (SSR) sur gels d'agarose haute-résolution ou polyacrylamide (séquenceurs LiCor).

- Marqueurs SNP (single-nucleotide polymorphism) par la méthode CAS-PCR (Competitive Allele-Specific PCR) ou sous-traités (méthode KASPar, Illumina Infinium, Affymetrix, ou GBS (Génotypage par Séquençage)).

- Autres méthodes de génotypage : CAPS (Cleaved Amplified Polymorphic Sequences) ou IDP (Insertion-Deletion Polymorphism) sur séquenceur, AFLP (Amplified Fragment Length Polymorphism), SSAP (Sequence-Specific Amplified Polymorphsim).

- Analyses de polymorphisme par séquençage "vertical" de séries alléliques dans le cadre de projets de génétique d'association ou d'études de diversité.

2. Analyse du niveau d'expression de gènes par RT-PCR quantitative en temps réel, sur blé, tournesol et maïs

3. Cartographie génétique

L'équipe fournit un service de cartographie de gènes de maïs et développe des outils moléculaires et des logiciels pour la production de cartes génétiques à partir de populations en segrégation.