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Responsable de publication :

Dominique de Vienne

Responsable éditorial :

Rozenn Le Guyader

Administrateur de l'infoservice :

Thierry Balliau

Directeur Dominique de Vienne, Professeur Université Paris Sud
Directeurs adjoints


Catherine Damerval, Directrice de recherche CNRS

Philippe Brabant, Professeur, AgroParisTech

Alain Charcosset, Directeur de recherche INRA

 

L’UMR de Génétique Végétale du Moulon est rattachée à l’INRA (UMR 320), à l’Université Paris-Sud et au CNRS (UMR 8120). Elle comprend une quarantaine de permanents relevant de ces trois établissements ainsi que des enseignants-chercheurs d'AgroParisTech, et une vingtaine de doctorants, stagiaires et post-doctorants. Elle est l'une des quatre Unités constitutives de l'Institut Fédératif de Recherches "La Plante et son Environnement" (IFR 87, CNRS - INRA - Université Paris Sud - AgroParisTech - ENGREF) ; elle est également unité constitutive de l'institut sans murs "Diversité, Écologie et Évolution du Vivant" (IDEEV) relevant de l'université Paris Sud et du CNRS.

Thèmes et équipes de recherche

L'UMR a pour thématique scientifique principale la génétique et l’évolution des caractères à déterminisme complexe (caractères quantitatifs). Deux objectifs complémentaires sont poursuivis :

  • La recherche en génétique quantitative, à la fois fondamentale (modélisation de la variation quantitative, évolution des caractères quantitatifs) et appliquée (méthodologie de la sélection et ressources génétiques)
  • L’analyse de caractères quantitatifs particuliers choisis pour leur intérêt agronomique et/ou pour la compréhension de mécanismes évolutifs (caractères de croissance, de développement, d’adaptation)
Les espèces étudiées sont principalement le maïs et le blé. Certains projets impliquent d'autres espèces, soit au titre de modèles (Arabidopsis thaliana, levure), soit pour aborder des questions spécifiques (Brassica, tournesol, Papavéracées). Les activités de recherche de l’UMR sont organisées au sein de cinq équipes de recherche :

Génétique Quantitative Fondamentale (GQF) - Responsable : Christine Dillmann, Université Paris Sud

Modélisation de la variation quantitative, en intégrant les niveaux génétique, moléculaire, génomique, physiologique (utilisation de la théorie du contrôle métabolique) et environnemental.


Génétique Quantitative Moléculaire et Protéomique (GQMP) - Responsable : Michel Zivy, CNRS
Caractérisation moléculaire et physiologique de gènes à effets quantitatifs impliqués dans la réponse du maïs au déficit hydrique par une approche « gènes et protéines candidats ». Cette stratégie est fondée sur une analyse quantitative de la variabilité d’expression des protéines.


Génétique Evolutive : Adaptation et Redondance (GEAR) - Responsable : Maud Tenaillon, CNRS

Etude des mécanismes évolutifs à l’origine de la diversité phénotypique, avec un intérêt particulier pour le rôle potentiel de la redondance génétique. Les thèmes abordés concernent l’évolution des gènes dupliqués, la domestication, la polyploïde et la symétrie florale.


Génétique Quantitative et Méthodologie de la Sélection (GQMS) - Responsable : Alain Charcosset, INRA

Etude des bases génétiques de caractères complexes et des mécanismes de réponse à la sélection, à partir de l'analyse de la diversité au sein de collections et de populations expérimentales. Optimisation de la gestion des ressources génétiques et du processus de sélection en utilisant les résultats de ces études ainsi que des approches théoriques.


Diversité, Evolution et Adaptation des Populations (DEAP) - Responsable : Isabelle Goldringer, INRA

Sur le modèle expérimental blé, étude de la gestion dynamique de la biodiversité cultivée et de sa valorisation à travers des agro-écosystèmes durables et innovants.

 

Structures transversales

L'Atelier Cartographie Expression Polymorphisme (responsable Matthieu Falque, INRA) assure un appui aux projets de recherche des différentes équipes, une veille technologique dans le domaine de la biologie moléculaire, et mène des activités transversales de cartographie génétique et de génomique.

L'Atelier de Bio-informatique et Informatique (ABI, responsable Johann Joets, INRA) fournit de l'expertise en bioinformatique et du support informatique à l'UMR. L'équipe comprend 5 informaticiens et bioinformaticiens permanents dont les champs de compétence sont l'administration système, le développement de logiciels et la bio-analyse. Ils développent des bases de données et logiciels pour la protéomique, la génétique et la génomique. ABI propose des ressources matérielles, effectue de la programmation de chaînes de traitement et offre du conseil pour l'analyse de séquences d'ADN, d'ARN et de protéines à l'échelle du génome entier. ABI travaille en étroite collaboration avec les équipes de bio-informatique de l'Université Paris-Sud et de l'INRA.

La Plate-forme de protéomique (PAPPSO, responsables Michel Zivy, CNRS, & Benoît Valot, INRA) assure, pour l’UMR comme pour des laboratoires extérieurs, des prestations dans les domaines de la protéomique comparative et de l’analyse des protéines par spectrométrie de masse. PAPPSO est la plate-forme de protéomique de l’IFR "La Plante et son environnement".

Implication dans des réseaux scientifiques

  • L’Unité d’Expérimentation (directeur Pascal Bertin, INRA) assure l’expérimentation génétique en plein champ pour l’UMR et diverses unités INRA, accueille des expériences pédagogiques pour l’Université Paris Sud et l’AgroParisTech, enfin a des activités de sélection, de finition et de maintenance de variétés.
  • L'UMR du Moulon est fortement impliquée dans le programme ANR Génoplante, mais aussi dans les programmes ANR Biodiversité, Non-thématique, et Jeunes Chercheurs.
  • Des partenariats existent avec Promaïs, Biogemma et ARVALIS.
  • Au niveau européen, l’UMR est impliquée dans divers programmes bilatéraux.
  • Des collaborations avec des Universités étrangères et avec le CIMMYT (Mexique) sont engagées.

Relations avec l'enseignement supérieur

Avec sept enseignants-chercheurs de l'Université Paris-Sud et d'AgroParisTech mais également avec la participation des chercheurs INRA ou CNRS, l'UMR est fortement impliquée dans l’enseignement. En particulier certains d'entre eux sont responsables de formations :
  • Master Sciences du Végétal (Université Paris Sud et AgroParisTech) - P. Brabant : UE Génétique Quantitative et Sélection Végétale et UE Planification d’expériences et analyse de données. C. Dillmann et D. Sicard : UE Génétique de la variation phénotypique.
  • Master Génomes, Cellules, Développement et Evolution (Universités Paris Sud, UPMC, Paris VII, et AgroParisTech). D. de Vienne : UE Génétique Multifactorielle (avec l’université Paris VII et l’INA PG).
  • Masters de biologie (Université Paris Sud). D. Manicacci et D. Sicard : UE Biostatistiques.
  • Master Pro Amélioration des plantes et Biotechnologies (Université Paris VII, Université d’Evry, AgroParisTech). I. Goldringer : UE Génomique et Productivité Végétale.
  • DAA Ingénierie de la Production Végétale (AgroParisTech) : P. Brabant.
  • Modules d’approfondissement d'AgroParisTech. C. Dillmann : Modélisation du hasard en biologie et Biotechnologies et Agriculture. P. Brabant et K. Alix : La transformation des plantes par l’homme : de la domestication à la transgenèse.
  • Licence d’Optométrie et PCEM (Université Paris Sud). D. Manicacci : statistiques pour biologistes.
  • Formation pédagogique des moniteurs de biologie (Université Paris Sud) : D. Manicacci.

L’UMR contribue à la formation à la recherche et par la recherche, en accueillant chaque année de quinze à vingt stagiaires de fin de Licence, de Master Recherche ou Professionnel, de DAA, ou de diverses écoles professionnelles (ingénieurs, BTS).
Il y a en permanence entre cinq et dix étudiants en thèse. Les Equipes d’Accueil de Doctorants de l’UMR sont rattachées aux Ecoles Doctorales "Gènes, Génomes, Cellules", "Sciences du Végétal", ou ABIES. Dix chercheurs et enseignants-chercheurs sont habilités à diriger des recherches.